Тест-системы для детекции и идентификации ГМО
    • тест-системы используются для выполнения работ по детекции и идентификации ГМО растительного происхождения методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени как в классическом, так и в матричном форматах;
    • 78 тест-систем включают праймеры, зонды и плазмиды (положительный контроль) для определения 31 трансформационного события (в том числе, всех линий, зарегистрированных в том или ином виде для использования в Российской Федерации), 17 смысловых последовательностей, 13 регуляторных последовательностей (промоторы, терминаторы), 4 селективных маркерных гена и 13 видов основных сельскохозяйственных культур, подвергающихся генно-инженерному модифицированию - с целью установления видовой принадлежности исследуемого образца;
    • позволяют идентифицировать в одном опыте (за 35-40 минут) 31 трансформационное событие сельскохозяйственных ГМ-культур и одновременно детектировать (по генетическим элементам) большинство ГМ-растений, зарегистрированных в мире (кукуруза: ~91%, соя: ~92%; рапс: ~93%…);
    • тест-системы валидированы с использованием референсных образцов генно-инженерно модифицированных культур, предоставленных ФГБУН «ФИЦ питания и биотехнологии» в рамках разработки Методических указаний "Детекция и Идентификация ГМО Растительного Происхождения Методом Полимеразной Цепной Реакции в Матричном Формате" (МУК 4.2.3390-16), а также стандартных референсных материалов производства ERM JRC EC, American Oil Chemists' Society и Sigma-Aldrich;
    • основные тест-системы валидированы круговым тестированием (ring-test) и сертифицированы Объединённым Научным Центром ЕС (JRC EU), и подтверждены организациями Европейской Сети ГМО-лабораторий (ENGL)
    Линии
    Объект Мишень Олигонуклеотиды Источник
    Кукуруза<br><b>176</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 82 п.н. PRF: GGCCGTGAACGAGCTGTT<br>PRR: GGGAAGAAGCCTACATGTTTTCTAA<br>PR: FAM-AGCAACCAGATCGGCCGACACC-BHQ1 Savini C, Bonfini L, Querci M, Mazzara M, Cordeil S, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line Bt176 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2011.
    Кукуруза<br><b>3272</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 95 п.н. PRF: TCATCAGACCAGATTCTCTTTTATGG<br>PRR: CGTTTCCCGCCTTCAGTTTA<br>PR: FAM-ACTGCTGACGCGGCCAAACACTG-BHQ1 Charles Delobel C, Foti N, Mazzara M, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Event 3272 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2008. JRC48922
    Кукуруза<br><b>5307</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 107 п.н. PRF: CATGGCCGTATCCGCAATGTG<br>PRR: TGCACCCTTTGCCAGTGG<br>PR: FAM-ACCACAATATACCCTCTTCCCTGGGCCAG-BHQ1 Hart H. Event 5307 Maize. Real-time, Event-specific Polymerase Chain Reaction Method. Annex B. 2011
    Кукуруза<br><b>Bt11</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 70 п.н. PRF: GCGGAACCCCTATTTGTTTA<br>PRR: TCCAAGAATCCCTCCATGAG<br>PR: ROX-AAATACATTCAAATATGTATCCGCTCA-BHQ2 Mazzara M, Puumalaainen J, Van den Eede G. Validation of the GMO Specific Detection Method Developed by NVI/NRA for Bt11 in Sweet Corn Maize - Validation Report and Protocol. 2005. JRC32111
    Кукуруза<br><b>GA21</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 112 п.н. PRF: CTTATCGTTATGCTATTTGCAACTTTAGA<br>PRR: TGGCTCGCGATCCTCCT<br>PR: ROX-CATATACTAACTCATATCTCTTTCTCAACAGCAGGTGGGT-BHQ2 Paoletti C, Mazzara M, Puumalaainen J, Rasulo D, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line GA21 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2005. JRC32087
    Кукуруза<br><b>LY038</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 112 п.н. PRF: TGGGTTCAGTCTGCGAATGTT<br>PRR: AGGAATTCGATATCAAGCTTATCGA<br>PR: FAM-CGAGCGGAGTTTATGGGTCGACGG-BHQ1 Charles Delobel C, Grazioli E, Larcher S, Mazzara M, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Maize Line LY038 Using Real-time PCR - Validation Report and Protocol. EUR 23647 EN. Luxembourg (Luxembourg): Publications Office of the European Union, 2008. JRC48919
    Кукуруза<br><b>MIR162</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 92 п.н. PRF: GCGCGGTGTCATCTATGTTACTAG<br>PRR: TGCCTTATCTGTTGCCTTCAGA<br>PR: FAM-TCTAGACAATTCAGTACATTAAAAACGTCCGCCA-BHQ1 Charles Delobel C, Mazzara M, Bevilacqua A, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize MIR162 by Real-time PCR. Validation Report and Protocol. 2011. JRC68155
    Кукуруза<br><b>MIR604</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 76 п.н. PRF: GCGCACGCAATTCAACAG<br>PRR: GGTCATAACGTGACTCCCTTAATTCT<br>PR: ROX-AGGCGGGAAACGACAATCTGATCATG-BHQ2 Mazzara M, Munaro B, Foti N, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line MIR604 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2007. JRC37490
    Кукуруза<br><b>MON810<b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 92 п.н. PRF: TCGAAGGACGAAGGACTCTAACGT<br>PRR: GCCACCTTCCTTTTCCACTATCTT<br>PR: FAM-AACATCCTTTGCCATTGCCCAGC-BHQ1 ISO 21569:2005: Foodstuffs-Methods of analysis for the detection of genetically modified organisms and derived products-Qualitative nucleic acid based methods
    Кукуруза<br><b>MON863</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 84 п.н. PRF: TGTTACGGCCTAAATGCTGAACT<br>PRR: GTAGGATCGGAAAGCTTGGTAC<br>PR: ROX-TGAACACCCATCCGAACAAGTAGGGTCA-BHQ2 Mazzara M, Foti N, Price S, Paoletti C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line MON 863 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2005. JRC32105
    Кукуруза<br><b>MON88017</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 94 п.н. PRF: GAGCAGGACCTGCAGAAGCT<br>PRR: TCCGGAGTTGACCATCCA<br>PR: ROX-TCCCGCCTTCAGTTTAAACAGAGTCGGGT-BHQ2 Charles Delobel C, Foti N, Grazioli E, Mazzara M, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line MON 88017 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2008. JRC48920
    Кукуруза<br><b>MON89034</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 77 п.н. PRF: TTCTCCATATTGACCATCATACTCATT<br>PRR: CGGTATCTATAATACCGTGGTTTTTAAA<br>PR: FAM–ATCCCCGGAAATTATGTT–MGBNFQ Savini C, Bogni A, Grazioli E, Munaro B, Mazzara M, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line MON 89034 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2008. JRC48921
    Кукуруза<br><b>MZIR098</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 73 п.н. PRF: ATCTCAGACACCAAACCGAGATC<br>PRR: ACACCGTTAGGCTAGTGCCAGT<br>PR: FAM-CAAGTGACAGCGAACGGAGCTGGTTT-BHQ1 European Union Reference Laboratory for GM Food and Feed (EURL GMFF), Joint Research Centre (JRC), European Commission. Event-specific Method for the Quantification of Maize MZIR098 Real-time PCR - Validation Report. 2018. JRC 114043. Online Publication
    Кукуруза<br><b>MZHG0JG</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 153 п.н. PRF: TTAGCTAACGGCCAGGATC<br>PRR: CACCGTGACATGCTTAGCA<br>PR: FAM-CGCGTGAGCCTTTAGCAACTAGC-BHQ1 ГенБит
    Кукуруза<br><b>NK603</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 108 п.н. PR: ATGAATGACCTCGAGTAAGCTTGTTAA<br>PRR: AAGAGATAACAGGATCCACTCAAACACT<br>PR: ROX-TGGTACCACGCGACACACTTCCACTC-BHQ2 Mazzara M, Paoletti C, Puumalaainen J, Rasulo D, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line NK603 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2005. JRC32103
    Кукуруза<br><b>T25</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 102 п.н. PRF: ACAAGCGTGTCGTGCTCCAC<br>PRR: GACATGATACTCCTTCCACCG<br>PR: ROX-TCATTGAGTCGTTCCGCCATTGTCG-BHQ2 Mazzara M, Grazioli E, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line T25 Using Real-Time PCR v. 1.01 - Validation Report and Validated Method. 2013. JRC84152
    Кукуруза<br><b>TC1507</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 58 п.н. PRF: TAGTCTTCGGCCAGAATGG<br>PRR: CTTTGCCAAGATCAAGCG<br>PR: FAM-TAACTCAAGGCCCTCACTCCG-BHQ1 Mazzara M. Foti N, Price S, Paoletti C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Maize Line TC1507 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2005. JRC32120
    Кукуруза<br><b>DAS-40278-9</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом кукурузы<br>Длина амликона: 98 п.н. PRF: CACGAACCATTGAGTTACAATC<br>PRR: TGGTTCATTGTATTCTGGCTTTG<br>PR: FAM-CGTAGCTAACCTTCATTGTATTCCG-BHQ1 Savini C, Bogni A, Foti N, Mazzara M, Kreysa J. Event-specific Method for the Quantification of Maize DAS-40278-9 by Real-time PCR - Validation Report and Validated Method - Sampling and DNA Extraction of Maize TC15O7. EUR 25585 EN. Luxembourg (Luxembourg): Publications Office of the European Union, 2012
    Рапс<br><b>GT73 (RT73)</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом рапса<br>Длина амликона: 108 п.н. PRF: CCATATTGACCATCATACTCATTGCT<br>PRR: GCTTATACGAAGGCAAGAAAAGGA<br>PR: FAM-TTCCCGGACATGAAGATCATCCTCCTT-BHQ1 Mazzara M, Grazioli E, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Oilseed Rape Line RT73 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2007. JRC37550
    Рис<br><b>LLRICE62</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом риса<br>Длина амликона: 88 п.н. PRF: AGCTGGCGTAATAGCGAAGAGG<br>PRR: TGCTAACGGGTGCATCGTCTA<br>PR: FAM-CGCACCGATTATTTATACTTTTAGTCCACCT-BHQ1 Mazzara M, Grazioli E, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Rice Line LLRICE62 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2006. JRC34091
    Сахарная свёкла<br><b>H7-1</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом сахарной свеклы<br>Длина амликона: 108 п.н. PRF: TGGGATCTGGGTGGCTCTAACT<br>PRR: AATGCTGCTAAATCCTGAG<br>PR: FAM-AAGGCGGGAAACGACAATCT-BHQ1 Mazzara M, Foti N, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Sugar beet line H7-1 Using Real-Time PCR v. 1.01 - Validation Report and Valideted Method. 2013. JRC84121
    Соя<br><b>A2704-12</b> участок, содержащий инвертированные 3'- и 5'-последовательности гена bla<br>Длина амликона: 64 п.н. PRF: GCAAAAAAGCGGTTAGCTCCT<br>PRR: ATTCAGGCTGCGCAACTGTT<br>PR: ROX-GGAAGGGCGATCGGAGGACCG-BHQ2 Mazzara M, Querci M, Delobel C, Moens W, Cordeil S, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Soybean Line A2704-12 Using Real-Time PCR. Protocol. 2007
    Соя<br><b>A5547-127</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 71 п.н. PRF: CTATTTGGTGGCATTTTTCC<br>PRR: TGCGGCCAACTTACTTC<br>PR: FAM-ACAACGATGACGGTATGACATTGCGG-BHQ1 Mazzara M, Querci M, Luque-Perez E, Ermolli M, Cordeil S, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Soybean Event A5547-127 Using Real-Time PCR. Protocol. 2009
    Соя<br><b>BPS CV-127-9</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 88 п.н. PRF: AACAGAAGTTTCCGTTGAGCTTTAAGAC<br>PRR: CATTCGTAGCTCGGATCGTGTAC<br>PR: FAM-TTTGGGGAAGCTGTCCCATGCCC-BHQ1 Mazzara M, Querci M, Savini C, Bonfini L, Cordeil S, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Soybean CV127 Using Real-Time PCR. Protocol. 2011
    Соя<br><b>DP305423-1</b></b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 93 п.н. PRF: CGTGTTCTCTTTTTGGCTAGC<br>PRR: GTGACCAATGAATACATAACACAAACTA<br>PR: FAM-TGACACAAATGATTTTCATACAAAAGTCGAGA-BHQ1 Mazzara M, Munaro B, Delobel C, Grazioli E, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Soybean Event DP-305423-1 Using Real-Time PCR v. 1.01. Validation Report and Validated Method. 2013
    Соя<br><b>FG72</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 70 п.н. PRF : AGATTTGATCGGGCTGCAGG<br>PRR: GCACGTATTGATGACCGCATTA<br>PR: FAM–AATGTGGTTCATCCGTCTT–MGBNFQ Savini et al. Event-specific Method for the Quantification of Soybean FG72 Using Real-Time PCR. Validation Report and Protocol. 2012
    Соя<br><b>GTS 40-3-2</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 84 п.н. PRF: TTCATTCAAAATAAGATCATACATACAGGTT<br>PRR: GGCATTTGTAGGAGCCACCTT<br>PR: MGB FAM–CCTTTTCCATTTGGG–MGBNFQ Mazzara M, Querci M, Moens W, Grazioli E, Cordeil S, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Soybean Line 40-3-2 Using Real-Time PCR. Protocol. 2009.
    Соя<br><b>MON87701</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 89 п.н. PRF: TGGTGATATGAAGATACATGCTTAGCAT<br>PRR: CGTTTCCCGCCTTCAGTTTAAA<br>PR: FAM-TCAGTGTTTGACACACACACTAAGCGTGCC-BHQ1 Mazzara M, Querci M, Bonfini L, Charels D, Cordeil S, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Soybean Line MON 87701 Using Real-Time PCR. Protocol. 2011
    Соя<br><b>MON87708</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 91 п.н. PRF: TCATACTCATTGCTGATCCATGTAG<br>PRR: AGAACAAATTAACGAAAAGACAGAACG<br>PR: FAM-TCCCGGACTTTAGCTCAAAATGCATGTA-BHQ1 Savini et al. Event-specific Method for the Quantification of Soybean MON87708 Using Real-time PCR. Validation Report and Validated Method. 2013
    Соя<br><b>MON89788</b> 5'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 139 п.н. PRF: TCCCGCTCTAGCGCTTCAAT<br>PRR: TCGAGCAGGACCTGCAGAA<br>PR: ROX-CTGAAGGCGGGAAACGACAATCTG-BHQ2 Mazzara M, Querci M, Bogni A, Grazioli E, Cordeil S, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantification of Soybean Line MON 89788 Using Real-Time PCR. Protocol. 2008
    Соя<br><b>SYHT0H2</b> 3'-пограничный участок между вставкой и геномом сои<br>Длина амликона: 88 п.н. PRF: GGGAATTGGGTACCATGCC<br>PRR: TGTGTGCCATTGGTTTAGGGT<br>PR: ROX-CCAGCATGGCCGTATCCGCAA-BHQ2 Hart H. Event SYHT0H2 Soybean. Real-time, Event-specific Polymerase Chain Reaction Method. Assessment. 2012
    Смысловые гены
    Объект Мишень Олигонуклеотиды Источник
    Смысловой ген<br><b>bar</b> участок гена фосфинотрицин N-ацетилтрансферазы из <i>Streptomyces hydroscopicus</i><br>Длина ампликона: 60 п.н. PRF: ACAAGCACGGTCAACTTCC<br>PRR: GAGGTCGTCCGTCCACTC<br>PR: FAM-TACCGAGCCGCAGGAACC-BHQ1 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Смысловой ген<br><a href=#popBox_stacks_in_4921_page15 class=call-modal><b>cp4 epsps1</b></a> участок гена 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазы из <i>Agrobacterium tumefaciens</i><br>Длина ампликона: 226 п.н. PRF: GCATGCTTCACGGTGCAA<br>PRR1: TGAAGGACCTGTGGGAGAT<br>PRR2: TGAAGGACCGGTGGGAGAT<br>PR: FAM-CGCAACCGCCCGCAAATC-BHQ1 E. Barbau-Piednoir, P. Stragier, N. Roosens, M. Mazzara, C. Savini, G. Van den Eede, M. Van den Bulcke. Inter-laboratory Testing of GMO Detection by Combinatory SYBR Green PCR Screening (CoSYPS). Food Anal. Methods. 2014 / ГенБит
    Смысловой ген<br><a href=#popBox_stacks_in_4921_page15 class=call-modal><b>cp4 epsps2</b></a> участок гена 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазы из <i>Agrobacterium tumefaciens</i><br>Длина ампликона: 88 п.н. PRF: GGGATGACGTTAATTGGCTCTG<br>PRR: GGCTGCTTGCACCGTGAAG<br>PR: FAM-CACGCCGTGGAAACAGAAGACATGACC-BHQ1 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>mepsps</b> участок модифицированного гена 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазы из <i>Zea mays</i><br>Длина ампликона: 112 п.н. PRF: GTCGAAGCGGACAAAGCTG<br>PRR: CTGGGGGATCCACTAGTTCT<br>PR: ROX-CTGTAGTTGTTGGCTGTGGTGGAA-BHQ2 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>cry1A.105</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry1A.105 из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 133 п.н. PRF: TCAGAGGTCCAGGGTTTACAGG<br>PRR: GTAGTAGAGGCATAGCGGATTCTTG<br>PR: FAM-TCCACTTGTGCGACGAAGAATGTCT-BHQ1 Dinon A. et al. Development and validation of real-time PCR screening methods for detection of cry1A.105 and cry2Ab2 genes in genetically modified organisms // Anal Bioanal Chem (2011), 400:1433-1442
    Смысловой ген<br><b>cry1Ab</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry1Ab1 из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 77 п.н. PRF: CAGTTCCTGCTSAGCGAGTT<br>PRR: CCRAAGATGCCCCAGATG<br>PR: FAM-ATGTCCACSAGGCCCAGSACG-BHQ1 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>cry1Ac</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry1Ac из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 137 п.н. PRF: TACTTGGTGGAGAACGCATT<br>PRR: AAAGATACCCCAGATGATGTCA<br>PR: FAM-CACCTGGCACGAACTCGCTGAG-BHQ1 Dong et al. GMDD: a database of GMO detection methods // BMC Bioinformatics (2008), 9:260
    Смысловой ген<br><b>cry1F</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry1F из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 245 п.н. PRF: CATCTGATTGGAGCCTCTTTCTT<br>PRR: GGTAAGGGTGAAGTTGTTGATGG<br>PR: FAM-CGCACATCTTCTCTCAGTTGGGCA-BHQ1 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>cry2Ab</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry2Ab из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 120 п.н. PRF: TTCTAACTACTTCCCCGACTACTTC<br>PRR: GACGGAGAGGCGATGTTC<br>PR: ROX-TCTCTGGTGTTCCTCTCGTCGTCCGCA-BHQ2 Dinon A. et al. Development and validation of real-time PCR screening methods for detection of cry1A.105 and cry2Ab2 genes in genetically modified organisms // Anal Bioanal Chem (2011), 400:1433-1442
    Смысловой ген<br><b>cry3A</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry3A из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 147 п.н. PRF: CGACAGTTCTACCACTAAGGAT<br>PRR: TTTGTATAGAAGCTCACGAGGG<br>PR: FAM-CCAGAAGGGTATCTCCGTTGTG-BHQ1 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>mcry3A</b> участок модифицированного гена дельта-эндотоксина Cry3A из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 154 п.н. PRF: AACAACACCGAGGCCCTG<br>PRR: CAGCAGCACCACCAAGGACG<br>PR: FAM-CACCACGCTGATGCCCT-BHQ1 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>cry34Ab1</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry34Ab1 из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 167 п.н. PRF: CAAGACCAAGCTCGACGG<br>PRR: GGTTGTCGAAGTAGAGGCTGAT<br>PR: ROX-CGCACCTCCCCGACCAAC-BHQ2 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>cry35Ab1</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry35Ab1 из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 78 п.н. PRF: CCATGCTCGACACCAACAA<br>PRR: CGAGGGAGAGGTAGGTGGC<br>PR: ROX-TGTACGAGATCAGCAACCACGCC-BHQ2 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>cry3Bb1</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry3Bb1 из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 89 п.н. PRF: GAGCACGACACGATCAAGGT<br>PRR: AGGGTGGAGTTGGGGTTGT<br>PR: FAM-CAGCGGGTACTGGTTGTGGTTG-BHQ1 Jia et al. Screening genetically modified organisms using multiplex-PCR coupled with oligonucleotide microarray // Biosens. Bioelctron. 2006, 22(1): 71-77
    Смысловой ген<br><b>cry9C</b> участок гена дельта-эндотоксина Cry9C из <i>Bacillus thuringiensis</i><br>Длина ампликона: 198 b.p. PRF: CTGCTGCTGCTGAAGGATGC<br>PRR: CCTGCGGAACTGGTGGTAG<br>PR: ROX-CGGCGAGGGCTGGGGCTT-BHQ2 Jia et al. Screening genetically modified organisms using multiplex-PCR coupled with oligonucleotide microarray // Biosens. Bioelctron. 2006, 22(1): 71-77
    Смысловой ген<br><b>gox/gox v247</b> участок гена глифосатоксидазы из <i>Ochrobactrum anthropi</i></i><br>Длина ампликона: 99 п.н. PRF: ATGCTAGCCACCTTATCCG<br>PRR: TGAGACGACGAAGTTCCCA<br>PR: ROX-TCACCTTACCGTGTACCGTGGA-BHQ2 ГенБит
    Смысловой ген<br><b>pat</b> участок гена фосфинотрицин N-ацетилтрансферазы из <i>Streptomyces viridochromogenes</i><br>Длина ампликона: 68 п.н. PRF: TTGAGGGTGTTGTGGCTGGTA<br>PRR: TGTCCAATCGTAAGCGTTCCT<br>PR: ROX-CTTCCAGGGCCCAGCGTAAGCA-BHQ2 Weighardt F, Barbati C, Paoletti C, Querci M, Kay S, De Beuckeleer M, Van den Eede G. Real-Time Polymerase Chain Reaction-Based Arrpoach for Quantification of the pat Gene in the T25 Zea mays Event' Journal OF AOAC International, Vol. 87, No. 6, p. 1342-1355
    Смысловой ген<br><b>CP-PRSV-P</b> участок гена (CI) белка оболочки крапчатости папайи<br>Длина ампликона: 133 п.н. PRF: CGACTTTGACATCACTGGTGA<br>PRR: CTCAACGAATGTTCCTCCAAT<br>PR: FAM-TGGACCTATAGATGTCACGTTCGAGA-BHQ1 ГенБит
    Регуляторные и маркерные последовательности
    Объект Мишень Олигонуклеотиды Источник
    Промотор<br><b>p35S</b> участок промотора 35S вируса мозаики цветной капусты<br>Длина ампликона: 102 п.н. PRF: TCGTTGAAGATGCCTCTGC<br>PRR: CTTGCTTTGAAGACGTGGTT<br>PR: FAM-CAAAGATGGACCCCCACCCAC-BHQ1 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Промотор<br><b>pFMV</b> участок промотора 35S вируса мозаики норичника<br>Длина ампликона: 78 п.н. PRF: CAAAATAACGTGGAAAAGAGCT<br>PRR: TCTTTTGTGGTCGTCACTGC<br>PR: ROX-CTGACAGCCCACTCACTAATGC-BHQ2 Official Compendium of Analytical Methods according to § 64 LFGB (Food and Feed Law) (2014). Food Analysis, Detection of DNA sequence of the FMV-promoter (pFMV) in foodstuffs with real-time PCR. BLV L 00.00-148, Beuth, Berlin Koln
    Промотор<br><b>pNOS</b> участок промотора нопалинсинтазы из <i>Agrobacterium tumefaciens</i><br>Длина ампликона: 79 п.н. PRF: GTGACCTTAGGCGACTTTTGAAC<br>PRR: CGCGGGTTTCTGGAGTTTAA<br>PR: FAM-CGCAATAATGGTTTCTGACGTATGTGCTTAGC-BHQ1 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Промотор<br><b>pRice_actin</b> участок промотора актина 1 из <i>Oryza sativa</i><br>Длина ампликона: 95 п.н. PRF: TCGAGGTCATTCATATGCTTGAG<br>PRR: TTTTAACTGATGTTTTCACTTTTGACC<br>PR: FAM-AGAGAGTCGGGATAGTCCAAAATAAAACAAAGGTA-BHQ1 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Промотор<br><b>pSSuAra</b> участок промотора малой субъединицы рибулозобифосфаткарбоксилазы (RuBisCO) из <i>Arabidopsis thaliana</i><br>Длина ампликона: 95 п.н. PRF: GGCCTAAGGAGAGGTGTTGAGA<br>PRR: CTCATAGATAACGATAAGATTCATGGAATT<br>PR: FAM-CCTTATCGGCTTGAACCGCTGGAATAA-BHQ1 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Промотор<br><b>pTA29</b> участок промотора TA29 из <i>Nicotiana tabacum</i><br>Длина ампликона: 117 п.н. PRF: GAAGCTGTGCTAGAGAAGATGTTTATTC<br>PRR: GCTCGAAGTATGCACATTTAGCAA<br>PR: FAM-AGTCCAGCCACCCACCTTATGCAAGTC-BHQ1 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Промотор<br><b>pUbi</b> участок промотора убиквитина из <i>Zea mays</i><br>Длина ампликона: 76 п.н. PRF: GAGTAGATAATGCCAGCCTGTTAAAC<br>PRR: ACGCGACGCTGCTGGTT<br>PR: FAM-CGTCGACGAGTCTAACGGACACCAAC-BHQ1 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Терминатор<br><b>t35S</b> участок терминатора 35S вируса мозаики цветной капусты<br>Длина ампликона: 118 п.н. PRF: AGGGTTTCTTATATGCTCAACACATG<br>PRR: TCACCAGTCTCTCTCTACAAATCTATCAC<br>PR: ROX-AAACCCTATAAGAACCCTAATTCCCTTATCTGGGA-BHQ2 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Терминатор<br><b>tE9</b> участок терминатора малой субъединицы рибулозобифосфаткарбоксилазы из <i>Pisum sativum</i><br>Длина ампликона: 87 п.н. PRF: TGAGAATGAACAAAAGGACCATATCA<br>PRR: TTTTTATTCGGTTTTCGCTATCG<br>PR: ROX-TCATTAACTCTTCTCCATCCATTTCCATTTCACAGT-BHQ2 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Терминатор<br><b>tg7</b> участок терминатора g7 из <i>Agrobacterium tumefaciens</i><br>Длина ампликона: 97 п.н. PRF: ATGCAAGTTTAAATTCAGAAATATTTCAA<br>PRR: ATGTATTACACATAATATCGCACTCAGTCT<br>PR: ROX-ACTGATTATATCAGCTGGTACATTGCCGTAGATGA-BHQ2 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Терминатор<br><b>tNOS</b> участок терминатора нопалинсинтазы из <i>Agrobacterium tumefaciens</i><br>Длина ампликона: 98 п.н. PRF: ATGCTTAACGTAATTCAACAGA<br>PRR: ATCGTTCAAACATTTGGCAAT<br>PR: FAM-ATCGCAAGACCGGCAACAGGATTC-BHQ1 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Терминатор<br><b>tOCS</b> участок терминатора октопинсинтазы из <i>Agrobacterium tumefaciens</i><br>Длина ампликона: 85 п.н. PRF: CGGTCAAACCTAAAAGACTGATTACA<br>PRR: CGCTCGGTGTCGTAGATACT<br>PR: ROX-TCTTATTCAAATTTCAAAAGTGCCCCAGGG-BHQ2 Debode F., Janssen E., Berben G. Development of 10 new screening PCR assays for GMO detection targeting promoters (pFMV, pNOS, pSSuAra, pTA29, pUbi, pRice actin) and terminators (t35S, tE9, tOCS, tg7) // Eur Food Res Technol (2013) 236:659-669
    Терминатор<br><b>tORF25</b> участок терминатора ORF25 из <i>Agrobacterium tumefaciens</i><br>Длина ампликона: 165 п.н. PRF: ATCAGATTATTGACTGTCATTTGT <br>PRR: ATAATGTTGTCGGTATTTTGTAA <br>PR: FAM-CATATAGATTTTCACTGTGCGACGC-BHQ1 ГенБит
    Селективный маркер<br><b>bla</b> участок гена бета-лактамазы из <i>Escherichia coli</i><br>Длина ампликона: 85 п.н. PRF: CGTTTGGTATGGCTTCATTCA<br>PRR: CTAACCGCTTTTTTGCACAAC<br>PR: FAM-CCGGTTCCCAACGATCAAGG-BHQ1 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Селективный маркер<br><b>GUS</b> участок гена бета-глюкуронидазы из <i>Escherichia coli</i><br>Длина ампликона: 82 п.н. PRF: TTTCTTTAACTATGCCGGAATCCATC<br>PRR: CACCACGGTGATATCGTCCAC<br>PR: FAM-AATGCTCTACACCACGCCGAACACCTG-BHQ1 ГенБит
    Селективный маркер<br><b>nptII</b> участок гена неомицинфосфотрансферазы II из <i>Escherichia coli</i><br>Длина ампликона: 210 п.н. PRF: TCACCTTGCTCCTGCC<br>PRR: CCCCTGATGCTCTTCG<br>PR: ROX-ATGCAATGCGGCGGCTG-BHQ2 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Селективный маркер<br><b>pmi</b> участок гена фосфоманнозизомеразы из <i>Escherichia coli</i> <br>Длина ампликона: 149 b.p. PRF: GCGAACTGCCTTTCCTGT <br>PRR: ATCTTTATAGTTACGCTCGGC <br>PR: FAM-TCTCCATTCAGGTTCATCCAAACAAACA-BHQ1 ГенБит
    Видовая принадлежность
    Объект Мишень Олигонуклеотиды Источник
    Видовая принадлежность:<br><b>Картофель</b><br><i>(Solanum tuberosum)</i> участок гена UGPase<br>Длина ампликона: 89 п.н. PRF: GGACATGTGAAGAGACGGAGC<br>PRR: CCTACCTCTACCCCTCCTA<br>PR: ROX-TGAGGAGGTGCGAGGTAATGGTGGTAG-BHQ2 Savini C, Foti N, Mazzara M, Charles Delobel C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Event EH92-527-1 Potato Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2006. JRC34758
    Видовая принадлежность:<br><b>Кукуруза</b><br><i>(Zea mays)</i> участок гена <i>zein</i><br>Длина ампликона: 82 п.н. PRF: TTACCGCTTCAGACGATGCC<br>PRR: CATTATTTGCGACACATGCTC<br>PR: FAM-TGACGCCTAACATGATGTCACCA-BHQ1 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Видовая принадлежность:<br><b>Лён</b><br><i>(Linum </i>L.<i>)</i> участок гена SAD<br>Длина ампликона: 68 п.н. PRF: GCTCCACCCAGTCACCACCT<br>PRR: TGCGAGGAGATCTGGAGGAG<br>PR: ROX-TGTTGAGGGAGCGTGTTGAAGGGA-BHQ2 Rosario V. et al. Development of an event-specific assay for the qualitative and quantitative detection of the genetically modified flax CDC Triffid (FP967) // Food Control, 2014, 41:128-133
    Видовая принадлежность:<br><b>Подсолнечник</b><br><i>(Helianthus annuus)</i> участок гена TUB1<br>Длина ампликона: 128 п.н. PRF: CGTAGCATATCGTTTCACCG<br>PRR: TCAAGGCAATAGAGATTCCCAA<br>PR: ROX-AGGAAAAATGAGAGAAATCGTAAGCA-BHQ2 ГенБит
    Видовая принадлежность:<br><b>Пшеница</b><br><i>(Triticum </i>L.<i>)</i> участок гена ALMT1<br>Длина ампликона: 95 п.н. PRF: AATGACTGTGCCGTCTCCAGT<br>PRR: ACAGAGCCGTGTTCTCTGCA<br>PR: ROX-CGTGAAAGCAGCGGAAAGCCTCAGA-BHQ2 Vautrin S. and Zhang D. Real-Time Polymerase Chain Reaction Assay for Endogenous Reference Gene for Specific Detection and Quantification of Common Wheat-derived DNA (Triticum aestivum L.). J. AOAC Int. 2007, 90, 794-801
    Видовая принадлежность:<br><b>Рапс</b><br><i>(Brassica napus)</i> участок гена cruA<br>Длина ампликона: 101 п.н. PRF: GGCCAGGGTTTCCGTGAT<br>PRR: CCGTCGTTGTAGAACCATTGG<br>PR: FAM-AGTCCTTATGTGCTCCACTTTCTGGTGCA-BHQ1 Mazzara M, Grazioli E, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Oilseed Rape Line RT73 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2007. JRC37550
    Видовая принадлежность:<br><b>Рис</b><br><i>(Oryza sativa)</i> участок гена PLD<br>Длина ампликона: 68 п.н. PRF: TGGTGAGCGTTTTGCAGTCT<br>PRR: CTGATCCACTAGCAGGAGGTCC<br>PR: ROX-TGTTGTGCTGCCAATGTGGCCTG-BHQ2 Mazzara M, Grazioli E, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Rice Line LLRICE62 Using Real-Time PCR - Validation Report and Protocol. 2006. JRC34091
    Видовая принадлежность:<br><b>Свёкла</b><br><i>(Beta vulgaris)</i> участок гена GS2<br>Длина ампликона: 118 п.н. PRF: GACCTCCATATTACTGAAAGGAAG<br>PRR: GAGTAATTGCTCCATCCTGTTCA<br>PR: ROX-CTACGAAGTTTAAAGTATGTGCCGCTC-BHQ2 Mazzara M, Foti N, Savini C, Van den Eede G. Event-specific Method for the Quantitation of Sugar beet line H7-1 Using Real-Time PCR v. 1.01 - Validation Report and Valideted Method. 2013. JRC84121
    Видовая принадлежность:<br><b>Соя</b><br><i>(Glycine max)</i> участок гена <i>le1</i><br>Длина ампликона: 74 п.н. PRF: CCAGCTTCGCCGCTTCCTTC<br>PRR: GAAGGCAAGCCCATCTGCAAGCC<br>PR: ROX-CTTCACCTTCTATGCCCCTGACAC-BHQ2 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Видовая принадлежность:<br><b>Томат</b><br><i>(Solanum lycopersicum)</i> участок гена LAT52<br>Длина ампликона: 89 п.н. PRF: GACCACGAGAACGATATTTGC<br>PRR: CTTGCCTTTTCATATCCAGACA<br>PR: FAM-CTTTGCAGTCCTCCCTTGGGCT-BHQ1 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Видовая принадлежность:<br><b>Хлопчатник</b><br><i>(Gossypium hirsutum)</i> участок гена AdhC<br>Длина ампликона: 73 п.н. PRF: CACATGACTTAGCCCATCTTTGC<br>PRR: CCCACCCTTTTTTGGTTTAGC<br>PR: FAM-TGCAGGTTTTGGTGCCACTGTGAATG-BHQ1 Van den Eede G. Compendium of Reference Methods for GMO Analysis. JRC Reference Reports. 2011
    Видовая принадлежность:<br><b>Цикорий</b><br><i>(Cichorium </i>L.<i>)</i> участок гена ACT<br>Длина ампликона: 97 п.н. PRF: GCCAAATCCAGCTCATCAGT<br>PRR: CCTGTCCGTCGGGTAATTC<br>PR: FAM-ACGAATTACCCGACGGACAGG-BHQ1 ГенБит
    Видовая принадлежность:<br><b>Папайя</b><br><i>(Carica papaya)</i> участок гена химопапаина<br>Длина ампликона: 74 п.н. PRF: CCATGCGATCCTCCCA<br>PRR: CATCGTAGCCATTGTAACACTAGCTAA<br>PR: FAM-TTCCCTTCAT(BHQ1)CCATTCCCACTCTTGAGA Nakamura K. et al. Identification and Detection of Genetically Modified Papaya Resistant to Papaya Ringspot Virus Strains in Thailand // Biol. Pharm. Bull. 37(1) 1–5 (2014)
тест-системы для ПЦР-РВ

© 2017-2020 GenBit